Mezoterapi çok ince ve kısa iğne uçları kullanılmak suretiyle uygulanan bir yöntemdir. Mezoterapide ilaçların buradan emilimi çok az olduğu için, sistemik dolaşma ilaç geçimi de yok denecek kadar azdır. Yapılan enjeksiyon sayısı, hastaya, hastalığa ve enfeksiyonun yapılacağı bölgenin anatomisine bağlı olarak değişiklik göstermektedir.
Mezoterapi, sıklıkla estetik amaçlı olarak selülit ve bölgesel zayıflama başta olmak üzere cilt problemleri, cilt yaşlanması (anti aging) ,sıkılaşma, leke tedavisi ve saç dökülmesini engellemek amacıyla estetik te yaygın olarak kullanılır. Bunun yanında tamamlayıcı tıp uygulaması olarak da artirit gibi tüm eklem hastalıklarında, boyun, bel fıtığı, migren, adet ağrılarında, spor travmalarında, varis, lenfödem ve flebit gibi bazı damar hastalıklarında da başarılı bir şekilde kullanılmaktadır.
Mezoterapi çok ince mezoterapi iğneleri ile nokta nokta (point by point) 1-2 cm ararlıklı enjeksiyonlar yapılarak uygulanabilir. Micro needling ( Dermapen ) ile de mezoterapi ürünleri ilgili katmana verilebilir. Ayrıca Napaj yöntemi ile de yani derinin iğne ucu ile çizilmesi sureti ile de ürünler hedef katman gönderilebilir.
Lokal anestezik kremler , buz uygulaması ve vibrasyon (titreşim ) ile ağrı kontrolü sağlandığında mezoterapi ağrısız olarak uygulanabilir.